Emniyet Genel Müdürlüğü bünyesinde gerçekleştirilen yeni görev dağılımı kapsamında, eski İstanbul Emniyet Müdürü ve mevcut Emniyet Genel Müdür Yardımcısı Mustafa Çalışkan; Kaçakçılık ve Organize Suçlarla Mücadele, Narkotik, Özel Harekat ile Terörle Mücadele birimlerinin sorumluluğuna getirildi.
Açıklanan yeni yapılanmaya göre Çalışkan, Kaçakçılık ve Organize Suçlarla Mücadele Başkanlığı, Narkotik Başkanlığı, Özel Harekat Başkanlığı ve Terörle Mücadele Daire Başkanlığı görev alanlarını doğrudan koordine edecek.
Çalışkan, İstanbul Emniyet Müdürü olarak görev yaptığı süreçte dönemin İçişleri Bakanı Süleyman Soylu ile yaşadığı gerilimlerle kamuoyunun gündeminde yer almıştı. O dönemde Soylu’nun oğlunun kullandığı aracın polis çevirmesinde aranması üzerine Bakan Soylu’nun Çalışkan’ı telefonla aradığı, Çalışkan’ın ise bu aramayı yanıtsız bırakarak meşgule attığı iddia edilmişti.
Taraflar arasındaki gerginlik başlıklarından bir diğeri ise Sedat Peker’e sağlanan koruma polisi tahsisi konusu oldu. Peker, yayımladığı videolardan birinde Soylu’ya yönelik şu ifadeyi kullanmıştı:
Bana koruma polisini sen vermedin mi?
Soylu ise söz konusu koruma kararında Çalışkan’ın Terörle Mücadele Müdürlüğü dönemine işaret etmiş ve koruma görevlendirmesi talimatında Çalışkan’ın imzasının yer aldığı öne sürülmüştü.
Daha önce hakkında çıkan açığa alınma iddialarına yanıt veren Çalışkan, tepkisini şu sözlerle dile getirmişti:
Türkiye’deki en dürüst insanı neden dolayı açığa alacaklar çok merak ediyorum. Çıksın bir görelim bakalım. Türkiye’de insanlar var. Dürüst siyasetçiler var. En başta Sayın Cumhurbaşkanı var. Mustafa Çalışkan gibi bir insanı açığa kim alacak, nasıl alacak bir görelim bakalım. Çok merak ettim

